Selve undersøkelsen tar vanligvis bare ca 5 minutter og det er ikke behov for bedøvelse eller narkose.
Vanligvis vil du ligge i en gynekologisk stol med rumpen godt fremme på stolkanten eller du vil ligge med venstre side på en benk med knærne opp mot brystet.
Rektoskopet er et stivt rør med en lyskilde i enden. Legen vil legge på smøremiddel på skopet før det føres inn i endetarmen. Underveis i undersøkelsen vil legen ofte blåse opp endetarmen med luft for å få best mulig oversikt over slimhinnen.
Dersom overgangen mellom endetarmen og nederste delen av tykktarmen (sigmoideum) ikke er for svingete, vil legen ofte kunne føre skopet videre opp i nederste delen av tykktarmen og se etter sykdom også her.
Dersom legen oppdager områder i slimhinnen som kan representere sykdom slik som polypper, kreft eller betennelse, vil man gjerne ta vevsprøve fra slimhinnen i samme seanse. Vevsprøven taes gjennom rektoskopet.