Betennelsen oppstår gjerne flekkvis i tarmsystemet. Betennelsen ved Crohns sykdom er ikke forårsaket av bakterier eller virus, men er en autoimmun betennelse hvor kroppen angriper seg selv.
Forekomsten av Crohns sykdom i Norge er ca 1-2 av 1000 personer. Hvert år rammes omkring 300 nye personer av tilstanden. De fleste som rammes er ungdom og unge voksne mellom 15-25 år.